А админпанель это не сайт? Это приложение? ))) Двухфакторная авторизация включается для конкретного пользователя и применима именно к пользователю, и будет не важно где он будет входить в обычной части сайта или административной части сайта. Она работает везде без исключения. Так что можете пользоваться без проблем, все в DLE уже есть и работает без проблем.